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Descubren mecanismo molecular que confiere resistencia a nuevo antibiótico contra superbacterias

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CONICET Instituto De Biología Molecular Y Celular De Rosario IBR Antibióticos The Lancet Infectious Diseases Bacterias Multirresistentes Chemical Science Cefiderocol Resistencia a Los Antibióticos
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Los avances de un equipo del CONICET impacta directamente en los protocolos de uso y administración de cefiderocol en casos de infecciones causadas por microorganismos multirresistentes. Las nuevas consideraciones terapéuticas fueron publicadas en la prestigiosa revista The Lancet Infectious Diseases.

Brenda Warecki y Alejandro Vila en el laboratorio del Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Crédito de la imagen: IBR
Brenda Warecki y Alejandro Vila en el laboratorio del Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Crédito de la imagen: IBR

En un artículo publicado por el CONICET, con la firma de Elizabeth KarayekovÁrea de Comunicación del IBR (CONICET-UNR), Alejandro Vila, investigador del CONICET y líder del equipo de investigación en el Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario (IBR, CONICET-UNR*), señaló que “la resistencia a los antibióticos es una pandemia silenciosa”. Vila se ha dedicado por más de 20 años a entender cómo las bacterias logran eludir el efecto mortal que deberían causarles estas sustancias.

En su más reciente trabajo, publicado en la revista Chemical Science, el equipo de investigadores explicaron con precisión molecular cómo algunas bacterias pueden ser resistentes al cefiderocol, un antibiótico de última generación que prometía ser inquebrantable cuando comenzó a usarse en la clínica en 2019 para tratar infecciones multirresistentes, y que, sin embargo, ha ido acumulando casos clínicos donde se observan eventos de resistencia inexplicables.

Los resultados del estudio que se aborda aquí explican por qué en ciertas infecciones el cefiderocol no debería usarse y en cuales sí, generando nuevas consideraciones terapéuticas para el uso y la administración de este fármaco, que han sido difundidas en The Lancet Infectious Diseases, una de las publicaciones de ciencias médicas de mayor impacto mundial. “Este tipo de información salva vidas, por eso quisimos que nuestros resultados llegaran rápidamente al ámbito médico”, remarcó Vila.

Millones de muertes
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Modelo de bolas y varillas de cefiderocol obtenido de PubChem CID 77843966. Se optimizó la geometría con Avogadro2 (energía final MMFF94 de 55,416). La imagen se creó con BIOVIA Discovery Studio Visualizer y se recortó con GIMP. Crédito: Fuse809
Modelo de bolas y varillas de cefiderocol obtenido de PubChem CID 77843966. Se optimizó la geometría con Avogadro2 (energía final MMFF94 de 55,416). La imagen se creó con BIOVIA Discovery Studio Visualizer y se recortó con GIMP. Crédito: Fuse809

Se estima que las infecciones causadas por bacterias multirresistentes se cobran alrededor de dos millones de vidas humanas cada año a nivel mundial. Este número va en ascenso y se proyecta que podría llegar a 10 millones para el 2050. Según Vila, las bacterias resistentes siempre van a aparecer. El problema es que hay un cambio en la línea de tiempo: “Antes, cuando surgía un nuevo antibiótico en el mercado, la resistencia se veía a los cuatro o cinco años. Ahora, cuando salen nuevos fármacos, antibióticos o inhibidores, ya vemos que hay resistencia preexistente”.

El foco está puesto en desarrollar antibióticos que puedan enfrentar a las bacterias que portan genes para producir metalo-beta-lactamasas (MBLs). Estas enzimas son capaces de romper (hidrolizar) la estructura de la mayoría de los antibióticos, incluso logran inactivar a los más potentes de última generación. En esta búsqueda surge el cefiderocol, que actualmente figura en las guías clínicas de Estados Unidos y Europa como el tratamiento indicado para un amplio rango de infecciones causadas por bacterias que portan distintos genes MBLs. La variabilidad genética agrupa a estas enzimas en subclases, de las cuales NDM, VIM e IMP son las más frecuentes. Pero, aunque el cefiderocol es estable frente a la mayoría de las MBLs, se han ido registrando casos donde su eficacia es inconsistente ante las bacterias que portan las variantes NDM.

Para Vila y su equipo este dato no pasó desapercibido, por eso en 2020 comenzaron a trabajar para encontrar una explicación a esta falla del cefiderocol. Primero fue necesario adentrarse en las bases bioquímicas y estructurales de la reacción entre las distintas MBLs y el cefiderocol. Esto implica medir con precisión de milisegundos qué tan rápido trabajan las enzimas y qué factores influyen en esa velocidad.

“Trabajamos con representantes de las distintas familias de MBLs exponiéndolas frente al cefiderocol, y vimos que el comportamiento de las enzimas NDM era diferente al de las familias IMP y VIM. Mientras que NDM resultaba muy eficiente para inactivar al cefiderocol, en el caso de IMP y VIM identificamos que la reacción se inhibía muy rápidamente”, detalló Brenda Warecki, becaria doctoral del CONICET y primera autora del trabajo. Pudieron determinar que estas diferencias se debían a que la formación del producto de la reacción podía unirse a las enzimas VIM e IMP con alta afinidad, inhibiendo en consecuencia la reacción enzimática que rompe al antibiótico. Warecki explicó que “hicimos muchísimos experimentos y usamos diversas técnicas para luego poder identificar qué era y cómo quedaba unido ese producto a las enzimas. Fue en la integración de todos los experimentos que encontramos la explicación molecular al hecho que el cefiderocol no funcione cuando las bacterias portan variantes de la familia NDM”.

Según el artículo del CONICET, el primer impacto y el mensaje que los autores quieren transmitir con este trabajo es que si NDM está presente en un aislado clínico (ya sea Enterobacterias, Pseudomonas o Acinetobacter) no es recomendable usar cefiderocol porque la bacteria ya podría ser resistente o adquirir esta condición rápidamente. Vila insistió en la importancia de contar con este tipo de estudios que señalan que “un nuevo fármaco no es la solución para todo y que tiene que estar bien elegido para qué y cuándo se usa”. Para ello es necesario avanzar hacia terapias y diagnósticos de precisión microbiológica, donde no sólo se pueda identificar al microorganismo que causa la infección, sino también sus mecanismos de resistencia y qué enzimas están involucradas en éstos.

Vila precisó que “los antibióticos son como los recursos naturales, los tenemos que cuidar, no los tenemos que agotar porque son nuestros reservorios para defendernos”. Actualmente hay 70 tipos de antibióticos aprobados para uso clínico en el mundo, de los cuales entre 30 y 40 también lo están en nuestro país. El cefiderocol se usa actualmente en Estados Unidos, Europa, Japón, China y Taiwán. “En América Latina no se usa porque tiene un costo muy elevado; un tratamiento podría costar entre 35 mil y 50mil dólares”, precisó Warecki, y añadió que existe una organización global sin fines de lucro que está intentando comenzar a producir el cefiderocol en empresas de la región para garantizar el acceso a este fármaco en Argentina y otros países de América Latina.

Vila advirtió que se puede inferir que **la resistencia a cefiderocol en Argentina ya existe, teniendo en cuenta que el monitoreo de las infecciones realizado por el Servicio Antimicrobianos del Instituto Malbrán detecta que el 66 por ciento de las cepas intra hospitalarias de la bacteria Klebsiella pneumoniae son resistentes a carbapenemes. De acuerdo con los investigadores, cuando esté disponible el cefiderocol en la región, que para preservarlo, será fundamental controlar su uso tomando las recomendaciones de administración descriptas en el estudio que realizaron.

“Hace 15 años que trabajamos con el Malbrán y estamos en diálogo con infectólogos y microbiólogos clínicos de nuestro país y del mundo” destacó Vila. Y remarcó que “es muy importante que los científicos comuniquemos para distintas audiencias lo que estamos haciendo y que nos involucremos y trabajemos con los profesionales que están en el campo de batalla”.

Cita
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  • El artículo Descubren el mecanismo molecular que confiere resistencia a un nuevo antibiótico contra superbacterias, con la firma de Elizabeth Karayekov - – Área de Comunicación del IBR (CONICET-UNR), fue publicado por el CONICET en su sección de noticias.

Contacto PlaPampa (mailto: rijcardgonzalez@gmail.com)
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